از آنجا که محمد باقر در خاندانی شریف و اهل فضل و کمال رشد می‌یافت. از همان اوان کودکی به تحصیل علم تشویق و ترغیب شد، تحصیلات علوم دینی را در خردسالی در مشهد آغاز نمود و پس از چندی نزد اساتید و فضلای آن دیار به تلمذ پرداخت.

از اساتید او در مشهد مرحوم سیّد علی فرزند ابی الحسن موسوی عاملی است.[٢]

شیخ حرّ عاملی در کتاب امل الامل راجع به وی می‌نویسد:

او از بزرگان علما و فضلای عصر خویش و از شاگردان شیخ ما (شهید ثانی) بود. وی فردی زاهد، عابد، فقیه و با ورع بود. [٣]

استاد دیگر میرداماد که در رشد علمی وی تأثیر گذاشت، شیخ عزّالدین حسین پدر شیخ بهایی از علمای بزرگ منطقه جبل عامل لبنان بود. [٤]

دیگر استاد میرداماد، دایی گرامی‌اش، مرحوم عبدالعالی عاملی (م ٩٩٣ق) فرزند محقق کرکی است.

شیخ حرّ عاملی در امل الامل درباره وی می‌گوید:

[١]. قمی، شیخ عباس، همان.

[٢]. افندی اصفهانی، همان، ج ٥، ص ٤٣.

[٣]. حر عاملی، امل الامل، ج١، ص ١١٧.

[٤]. شیخ بهایی، احوال و اشعار، ص ١٠.